Bioinformatyka 2006/07 10 / 17.2007
KEGG : http://www.genome.ad.jp/KEGG/
COG: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/COG/
OMIM: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
1. W ilu sekwencjach białek występuje motyw charakterystyczny dla enzymu 1.1.1.44?
2. Czy L-cysteina jest używana w biosyntezie penicylin i cefalosporyn?
3. Ile enzymów używa cynku jako kofaktora?
4. Ile można zbudować ścieżek od L-alaniny do L-cysteiny?
5. Czy używając znanych enzymów można uzyskać L-fenyloalaninę z L-lizyny?
6. Znajdź liczbe obrotów (turnover) ludzkiej dehydrogenazy alkoholowej dla etanolu
7. Ile jest helis w białku odpowiedzialnym za fenyloketonurię?
8. Jaka mutacja jest najczęstszą przyczyną mukowiscydozy? (cystic fibrosis)
9. Znajdź ten substrat enzymu 5.3.1.9 który jest produktem metabolizmu galaktozy. W ilu ścieżkach metabolicznych występuje ta substancja? Ile jest enzymów, dla których jest substratem? Czy z tymi enzymami są związane znane choroby metaboliczne?
10. W ilu całkowicie znanych sekwencjach genomów występuje gen kodujacy elastazę?
Dla zainteresowanych:
Znajdź co najmniej trzy mutacje w genie ludzkiej elastazy odpowiedzialne za chorobę „cyclic neutropenia” . Zrób multiple alignment sekwencji elastaz i dla każdego ze znalezionych mutantów zobacz czy pozycja jest konserwowana w przynajmniej połowie naturalnych sekwencji.
biologia