wykład 13.pdf
(
485 KB
)
Pobierz
Aminokwasy
I
Aminokwasy
Związki dwufunkcyjne zawierające:
-
grupę kwasową (grupa karboksylowa -COOH lub grupa sulfonowa -
SO
3
H) i grupę
-
zasadową ( aminową -NH
2
)
δ
γ
β
NH
2
α
CH
3
CH
2
CH CH
2
COOH
NH
2
5
4
3
2
1
CH
3
CH CH
2
SO
3
H
kwas 3-aminopentanowy
-
-
(kwas β-aminopentanowy)
kwas aminosulfonowy
2-
COOH
NH
2
kwas
para
aminobenzoesowy
Aminokwasy w znaczeniu potocznym- kwasy karboksylowe posiadające grupę
aminową w położeniu α w stosunku do grupy karboksylowej. Aminokwasy
występują w przyrodzie w postaci wolnej lub w postaci związków o budowie
polimerycznej (peptydy, białka). Dotychczas poznano około 200 aminokwasów,
jednak zaledwie 20 z nich zaliczane jest do tzw. aminokwasów białkowych.
Αminokwasy występujące w przyrodzie to głównie
α-aminokwasy.
RCH
2
CH
2
CH
2
CH
2
CH COOH
NH
2
ε
δ
γ
β
α
6
5
4
3
2
1
Węgiel C
α
jest węglem asymetrycznym (za wyjątkiem glicyny wszystkie
aminokwasy są optycznie czynne).
W przyrodzie większość aminokwasów to L-aminokwasy:
COOH
H
2
N
H
R
-
II
Ponieważ aminokwasy zawierają zarówno grupę kwasową, jaki i zasadową,
ulegają one wewnątrzcząsteczkowej reakcji kwas-zasada i występują głównie w
formie
jonu
dipolowego albo
obojnaczego
(lub
Zwitterjonu
)
O
H
O
H
N
CH
R
C
O
H
H
N
CH
R
C
O
H
H
jon obojnaczy
"Zwitterjon"
Jony obojnacze aminokwasów są rodzajem wewnętrznych soli i dlatego
charakteryzują się wieloma właściwościami fizycznymi typowymi dla soli. Mają
duże momenty dipolowe, są rozpuszczalne w wodzie, ale nierozpuszczalne w
węglowodorach, są substancjami krystalicznymi o wysokich temperaturach
topnienia.
Aminokwasy zawierają co najmniej 2 słabo kwaśne grupy: -COOH i –NH
3
.
W roztworze obie formy występują w równowadze protonowej
:
RCOOH
RCOO
H
RNH
3
RNH
2
H
W pH osocza krwi ( pH 7,4) czy przestrzeni śródkomórkowej (pH 7,1) grupy
karboksylowe istnieją prawie całkowicie jako
jony karboksylowe
-
COO
a
większość grup aminowych (przy C
α
) występuje w formie protonowanej –
NH
3
To anion karboksylanowy, -COO
-
, a nie grupa aminowa działa jako centrum
zasadowe i przyłącza proton w roztworze kwaśnym:
H
O
H
H
NCH
C
O
+
H
3
O
HN
CH
R
COO
H
H
H
R
jon obojnaczy
środowisko kwaśne
kation
H
2
O
Podobnie, to kation amoniowy, -NH
3
, nie zaś grupa karboksylowa działa jako
centrum kwasowe i oddaje proton w roztworze zasadowym:
.
III
H
O
H
NCH
H
C
O
+
OH
HN
H
CH
R
COO
R
anion
jon obojnaczy
H
2
O
środowisko zasadowe
Punkt izoelektryczy
pI
to jest takie pH środowiska, w którym aminokwas
jako cała cząsteczka nie jest obdarzona żadnym ładunkiem.
Dla aminokwasu obojętnego
H
O
H
HN
H
CH
R
COO
H
NCH
C
O
HN
CH
R
COO
H
H
H
R
anion
jon obojnaczy
kation
śro dow isko k waśne
środowisko zasadowe
pH = pI
(np.pH
= 10)
(np. pH =2)
pI
=
pK
1
+ pK
2
pK
1
= pK monokationu
pK
2
= pK formy dipolarnej
2
IV
Aminokwasy białkowe:
¾
Aminokwasy obojętne
Glicyna
Gly
G
pK
1
= 2,4 pK
2
= 9,6
pI 5,97
α
CH COOH
2
2
1
NH
2
kwas 2-aminoetanowy
Alanina
Ala
A
pK
1
= 2,4 pK
2
+ 9,8
pI 6,02
CH
3
3
CH COO
H
2
1
kwas 2-aminopropanowy
NH
2
Walina
Val
V
pK
1
= 2,2 pK
2
= 9,7
pI 5,97
Egzogenny
CH
3
α
CH COOH
CH
CH
3
3
2
1
4
NH
2
kwas 2-amino-3-metylobutanowy
Leucyna
Leu
L
pK
1
= 2,3 pK
2
= 9,7
pI 5,98
Egzogenny
CH
3
α
CH COOH
CHCH
2
CH
3
4
3
2
1
NH
2
kwas 2-amino-4-metylopentanowy
Izoleucyna
Ile
I
pK
1
= 2,3 pK
2
= 9,8
pI 6,02
Egzogenny
5
4
CH
3
CH
2
3
α
CH COO
CH
H
2
1
CH
3
kwas 2-amino-3-metylopentanowy
NH
2
α
5
V
¾
Aminokwasy obojętne zawierające grupę hydroksylową
Seryna
Ser
S
pK
1
= 2,2 pK
2
= 9,2
pI 5,68
CH
2
3
CH COO
α
H
2
1
pK
3
= ~13
kwas 2-amino-3-hydroksypropanowy
OH
NH
2
Treonina Thr T
pK
1
= 2,1 pK
2
+ 9,1
pI 5,60
Egzogenny
α
CH
3
CH
CH COO
H
3
4
2
1
pK
3
= ~13
OH
NH
2
kwas 2-amino-3-hydroksybutanowy
¾
Aminokwasy obojętne zawierające siarkę
:
Cysteina
Cys
C
pK
1
= 1,9 pK
2
= 10,8 pK
3
= 8,3
pI 5,07
α
CH
CH COO
H
3
2
2
1
kwas 2-amino-3-merkaptopropanowy
NH
2
Metionina
Met
M
pK
1
= 2,1 pK
2
= 9,3
pI 5,75
Egzogenny
α
CH
3
S
CH
2
CH
CH COO
H
2
4
3
2
1
NH
2
kwas 2-amino-4-metylotiobutanowy
¾
Aminokwasy obojętne zawierające drugorzędowy atom azotu:
Prolina
Pro
P
pK
1
= 2,0 pK
2
= 10,6
pI 6,30
N
α
COOH
1
H
nie daje pozytywnego wyniku reakcji z ninhydryną
SH
2
Plik z chomika:
wrib.biologia
Inne pliki z tego folderu:
wykład 11-12.pdf
(358 KB)
wykład 10.pdf
(266 KB)
wykład 9.pdf
(176 KB)
wykład 8.pdf
(279 KB)
wykład 7.pdf
(340 KB)
Inne foldery tego chomika:
egzamin
sprawozdania 2010
Zgłoś jeśli
naruszono regulamin