Epidemiologia weterynaryjna

Jarosław Kaba

Epidemiologia weterynaryjna

Testy diagnostyczne I i II

Zadania

Warszawa

2009
Testy diagnostyczne
Wzory

Parametry testów diagnostycznych

SE = a / (a+c)

gdzie:

SE              - czułość testu

a              - liczba zwierząt chorych trafnie zdiagnozowanych przez test

a+c              - ogólna liczba zwierząt chorych

SP = d / (b+d)

gdzie:

SP              - swoistość testu

d              - liczba zwierząt zdrowych trafnie zdiagnozowanych przez test

b+d              - ogólna liczba zwierząt zdrowych

WP+ = a / (a+b)

gdzie:

WP+              - wartość predykcyjna dodatnia

a              - liczba zwierząt chorych trafnie zdiagnozowanych przez test

a+b              - liczba zwierząt zakwalifikowanych przez test jako chore

WP- = d / (c+d)

gdzie:

WP-              - wartość predykcyjna ujemna

d              - liczba zwierząt zdrowych trafnie zdiagnozowanych przez test

c+d              - liczba zwierząt zakwalifikowanych przez test jako zdrowe

AP = (a+b)/n

gdzie:

AP              - obliczona prewalencja (chorobowość)

a+b              - liczba zwierząt zakwalifikowanych przez test jako chore

TP = (a+c)/n

gdzie:

TP              - rzeczywista prewalencja (chorobowość)

a+c              - ogólna liczba zwierząt chorych

Porównanie zgodności wyników testów

Statystyka kappa

                            kappa = 2x (a x d - b x c) / [(a+c) x (c+d) + (a+b) x (b+d)]

Interpretacja wyników

Badania diagnostyczne seryjne

SEs=SE1 x SE2

SPs=1-(1-SP1) x (1-SP2)

SEs - czułość badań diagnostycznych seryjnych

SE1, SE2 - czułość pojedynczych badań diagnostycznych

SPs - swoistość badań diagnostycznych seryjnych

SP1, SP2 - swoistość pojedynczych badań diagnostycznych

Badania diagnostyczne równoległe

SEr=1-(1-SE1) x (1-SE2)

SPr=SP1 x SP2

SEr - czułość badań diagnostycznych równoległych

SE1, SE2 - czułość pojedynczych badań diagnostycznych

SPr - swoistość badań diagnostycznych równoległych

SP1, SP2 - swoistość pojedynczych badań diagnostycznych

Testy diagnostyczne

Zadania

Zadanie 1

Diagnostykę parazytologiczną w kierunku zarażenia pewnym nicieniem żołądkowo - jelitowym wykonuje się zwykle metodą koproskopową. Opracowano nową metodę serologiczną. Jest on szybka, daje się  zautomatyzować i przez to jest łatwa w zastosowaniu w przypadku dużej liczby próbek. Jak obliczyć czułość i swoistość nowej metody? 

Zadanie 2

Jedną z metod serologicznych wykorzystywanych w badaniach brucelozy jest aglutynacja próbówkowa. Przeprowadzono ocenę tej metody diagnostycznej w populacji 10 000 krów. Wiadomo, że w populacji tej było 300 zwierząt zakażonych, z których test wykrył jedynie 186. Test dał ogółem 234 wyniki dodatnie. Oblicz czułość i swoistość testu.

Zadanie 3

Właściciel stada owiec kupił od sąsiada maciorkę o wysokiej wartości hodowlanej. Przed dołączeniem do stada zbadał ją serologicznie w kierunku choroby maedi-visna. Okazało się, że maciorka jest serododatnia. Właściciel chce wiedzieć jakie jest prawdopodobieństwo, że jest ona rzeczywiście zakażona wirusem maedi-visna. O interpretację zwrócił się do lekarza opiekującego się jego stadem. Czy lekarz może mu na to pytanie odpowiedzieć? Jakie obliczenia należy wykonać i jakie dane będą do tego potrzebne?

Zadanie 4

W mieście istnieje kilka hodowli kotów syjamskich. Laboratorium diagnostyczne w ciągu pięciu ostatnich lat przebadało serologicznie 327 kotów pochodzących z tych hodowli i w 38 przypadkach stwierdzono zakażenie wirusem białaczki kotów. W diagnostyce laboratorium wykorzystuje  test ELISA o czułości 81% i swoistości 89%. Hodowca z innego miasta przed zakupem dorosłego kocura dostarczył próbkę surowicy do laboratorium. Uzyskano wynik ujemny. Jakie jest prawdopodobieństwo, że zwierzę to rzeczywiście nie jest zakażone wirusem białaczki kotów?

Zadanie 5

Do diagnostyki serologicznej wirusowego zapalenia stawów i mózgu kóz wykorzystuje się często metodę ELISA. Jest to metoda wysoce czuła (90%) i wysoce swoista (90%). Testy te zastaną zastosowane w rutynowej diagnostyce w trzech laboratoriach. Każde laboratorium będzie diagnozowało 1000 zwierząt

A

Laboratorium diagnostyczne A działa na terenie gdzie choroba występuje rzadko (1 koza zakażona na 100). Oblicz wartości predykcyjne dodatnią i ujemną testu.

B

Laboratorium diagnostyczne B działa na terenie gdzie choroba występuje stosunkowo często (30 kóz zakażonych na 100). Oblicz wartości predykcyjne dodatnią i ujemną testu.

C

Laboratorium diagnostyczne C działa na terenie gdzie choroba występuje b...